Vì vậy, để tận thu hết khoáng sản, tránh lãng phí, UBND tỉnh đã cho phép các đơn vị khai thác đến hết độ sâu phân bố quặng. Tuy nhiên, trước khi xem xét cấp phép khai thác, các đơn vị đều đã phải lập báo cáo đánh giá tác động môi trường bổ sung, trình bày đầy đủ các biện pháp khai thác đảm bảo cảnh quan môi trường trong và sau khi khai thác đến độ sâu nêu trên, đồng thời UBND tỉnh không cho phép đơn vị nào khai thác đến độ sâu 40 - 50m.
Riêng tại khu vực Vũng Môn, đơn vị khai thác có mở moong khai thác vượt chiều sâu cho phép đến độ sâu khoảng 50m, việc này đã được các ngành kiểm tra, xử lý theo quy định, đồng thời đã đình chỉ hoạt động khai thác tại khu vực này và yêu cầu khắc phục lại hiện trạng.
Đối với việc lén lút bơm nước biển để tuyển quặng thì trong báo cáo đánh giá tác động môi trường và ngay cả trong giấy phép khai thác đã quy định rõ việc không cho phép sử dụng nước biển để tuyển quặng. Việc lén lút bơm nước biển của các đơn vị là do ý thức chấp hành của các đơn vị khai thác chưa tốt cũng như do điều kiện khó khăn về nguồn nước ngọt tại các khu vực trên.
Thời gian qua, các cơ quan chức năng của tỉnh Bình Thuận đã tích cực, thường xuyên kiểm tra, nghiêm khắc xử lý các sai phạm theo quy định, cụ thể tại khu vực Thiện Ái, huyện Bắc Bình có 5 đơn vị khai thác thì đã kiểm tra, xử phạt, yêu cầu tháo dỡ các đường ống, lấp hết các ao, hồ phía biển để ngăn chặn triệt để nguy cơ lén lút bơm nước biển của các đơn vị.
Mặt khác, sau khi giấy phép hết hạn, Sở Tài nguyên và Môi trường đã yêu cầu dừng khai thác, đồng thời tăng cường kiểm tra tại thực địa, nhiều lần mời các công ty làm việc, nhắc nhở, xử lý và báo cáo UBND tỉnh có văn bản yêu cầu tháo dỡ toàn bộ đường ống dẫn nước, lấp các ao chứa nước biển, di dời toàn bộ các bãi chứa quặng, trồng cây hoàn phục môi trường, xin cấp giấy phép khai thác nước ngọt, giấy phép xả thải vào nguồn nước, bổ sung, hoàn thiện các hồ sơ, thủ tục còn thiếu,... sau đó mới xem xét, gia hạn.
